Moderkyrkan främjar denna målsättning genom att leda och stödja och samordna utövningen av de religiösa förrättningarna, utbildningen av prästerskapet och personalen, ledningen av kyrkan och spridningen av budskapet, samt de samhällsförbättrande aktiviteterna.
Den Internationella Scientologi-kyrkan hanterar även utgivelse och distribution av scientologernas skrifter över hela världen. Detta sker genom två förlagsverksamheter, ett beläget i Förenta Staterna (Los Angeles) och ett annat i Danmark (Köpenhamn). Därutöver har moderkyrkan en intern avdelning, Golden Era Productions, som producerar religiösa filmer, videoband, ljudband och laserdiscs i sin egen filmstudio.
De kyrkor som förser församlingsmedlemmarna med religiösa förrättningar är organiserade i en hierarki, som speglar de stigande graderna i religionens andliga nivåer (jämför Bron till total frihet: klassificerings-, graderings- och medvetandetabellen s. 56). Som diskuteras närmare nedan utförs Scientologins religiösa förrättningar av oberoende fältpastorer och av kyrkor av olika format.